2013-01-01から1年間の記事一覧

miRNA解析をBioConductor上でやりたいのだけれど

miRNAのマイクロアレイの解析を頼まれて、非常に困った。 library(affy) exp <- exprs(eset <- rma(Data <- ReadAffy())) cl <- c(rep(0,10),rep(1,10)) library(siggenes) summary(sig <- sam(eset, cl, B=1000)) みたいなド定番で何の工夫もないやり方にし…

BD-1のタイヤを交換することにした

気がつくと、後輪のトレッドがなくなっていて、ワイヤーが露出してた。 後輪はPanaracer Pasela Compactを昨年の6月に交換してた。1年ちょっとか。意外と短命。前輪に履いてるSCHWALBE MARATHON RACERなんてまだまだイケるのに、、と思って前輪を改めて見て…

いわゆるメッセンジャー・バッグを買った

メッセンジャー・バッグが欲しくて、Timbuk2かCrumplerあたりのド定番のシンプルな色味のヤツを買おうかと思ってたんだけれど、なんとなくFREDRIK PACKERSのBIKE PACKを職場から近いUNITでワリと衝動的に買ってしまった。 UNITではいろいろと目移りしたんだ…

靴を買いました

実物があったので、つい。 DZR Mambaって、スニーカーっぽいビンディングシューズ。 普通の靴屋で靴を買うのにも苦労する程度に大きいサイズなので、こういう特殊な靴はサイズが有ることが確認できた時点で買っておかないといけないんだ。 これから、靴底を…

カーシェアリング

単身赴任になって、自宅にクルマを置いてきちゃったのだけれど、どうしても単身赴任先でもクルマが必要になることがたまにある。単身赴任になってこの2年間で、3回くらい有った。3回かよ。If I had a car,...(仮定法過去)って思うことは数しれず。 というこ…

Up by Jawboneのバッテリー問題について

先週末にメールで「10日連続使用可能って書いてあるのに1日しかバッテリーがもたないんだけれど、どこをどう設定すると10日連続使用可能にできるのか確認すべき点を教えて」とかなんとか問い合わせたところ、自動応答で「2日以内に返事します」ってことだっ…

UPをしばらく使ってみた感想とか

まだまだ使いこなせてないんだけれど、一番気になってるのは、「バッテリーのもち」だ。 毎日充電しないと、使いもんにならない。カタログスペック上は10日もつことになってるけれど、実際には1日だ。昼間に満充電にしておいても、翌朝に起きてから睡眠状態…

UP by Jawboneを購入

日本でも正式に販売になったと聞いてから、ずいぶんと探してたんだけれど、ようやく購入できた。 amazonで並行輸入品を買おうか、expansysで買って個人輸入にしようか、と悩んでたんだけれど、ある日AppleStoreを覗いてみたら在庫有りになってた。 というワ…

KASK Mojitoをwiggleから購入

仕事から帰宅すると、郵便局の不在票が入っていた。届いたっぽい。22時以降24時までなら窓口で受け取れるので、取りに行ってくる。定価21000円だけれど、多分、15000円くらいで買えた。安売りしてる店でも18000円くらいだったので、お得。急いでないときは通…

ビンディングペダル購入...しかし

ついにビンディングペダルを購入した。出町柳のアイバサイクルで相談したら、片面SPDならPD-A530がオススメだというので、じゃあ、ソレでって感じ。そして、取り付けもしてもらった。取り付け工賃込で6000円くらい。wiggleとかで購入するより高くついたけど…

ヘルメットをWiggleで購入

最近、自転車で長距離を移動するようになって、「やっぱりヘルメット必要かなー」って思いはじめた。で、ヘルメットって意外と高いのな。オレが昔バイクに乗ってた頃はショウエイのヘルメットを10000円くらいでディスカウント店で買ったりしてたもんだけれど…

GAE/py updated but ...

GoogleAppEngineLauncherを久々に起動したら、updateがかかった。version 1.7.7というヤツになった。 久々に、適当なアプリを作ろうと思ったんだけれど、これがびっくりするくらいやり方を覚えていなくて、「とりあえずhello worldからやりなおすか、、、」…

BioConductor needs fortran library...

先日のBioConductorでlibgfortran周りでエラーが出る件だけれど、http://cran.ism.ac.jp/bin/macosx/tools/ にあるgfortranの.pkgをインストールすればOKだった。 こういうのって分かるように書いといてくれよーって思うけれど、ホントはどこかにちゃんと分…

R-3.0.0 release but ...

R-3.0.0がリリースされてた。新しもの好きなので、早速インストールして、BioConductorもインストールしなおす。 試しに、ちょっとGEOのデータを使ってみるか、、、と、思ったら、さっそくハマった。 preprocessCoreといういつもお世話になっているlibraryが…

41歳の春ですよ

1990年春、大学に入学した僕らを迎えてくれたちょっと感動的だった言葉は「君たちは未来からの留学生です」ってヤツだった。 多分、あの頃の僕らの未来ってのは、ちょうど今ぐらいのイメージだったんじゃないかなと思うんだけれど、僕らを「未来からの留学生…

[Diary] GAE/pyとbulkloader

ファイルをアップロードしようとすると、bulkloaderを使う必要がある。 ところが、ドキュメントに書いてあるとおりにやるとエラーが出る。 % appcfg.py --email=XXXXXX@gmail.com update expressions/ 10:21 PM Host: appengine.google.com 10:21 PM Applica…

GAE/py 難航中

GAE/py始めましたとか言いつつ、なんだかちっとも先に進んでない。 ちょっと、本腰入れてやるか!と思いつつ、Tutorialは完了したところ。 「Using Google App Engine」という本を図書館で借りてきて、その本の通りに進めていたところ、Templatesのところで…

僕が禁煙した時の話

大学生になり、親元を離れて暮らすようになった僕は、いつの間にか喫煙者になっていた。若気の至りというヤツだ(遠い目)。 会社に入ってからも、喫煙室に入り浸ってた。2日で3箱くらい吸ってた。よく言われる「タバコ部屋コミュニケーション」というヤツは…